41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2609 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  50 
 
 		 231 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  38.32 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  39.56 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  33.83 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  35.84 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  35.03 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  38.29 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  36.16 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  30.23 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  31.15 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  28.65 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  38.95 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  34.35 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  36.17 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  35.79 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  32.05 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  31.37 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  28 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  31.63 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  30.53 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  32.53 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  29.82 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  30.69 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  29.03 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  28.12 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  34.21 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  31.37 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  33.64 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  30.84 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  31.73 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  30.97 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  42.86 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  32.95 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  26.79 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  27.19 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0137  hypothetical protein  34.41 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.314287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  29.55 
 
 		 164 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  26.5 
 
 		 246 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  35.05 
 
 		 236 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>