25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2626 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  42.79 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  45.26 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  39.75 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  40.91 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  29.44 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  29.74 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  25 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  38.05 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  26.84 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  25.78 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  31.39 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  39.05 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  28.18 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  33.6 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  27.52 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  31.63 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  29.07 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0632  hypothetical protein  36.11 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  31.19 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  24.43 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  34.74 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  27.61 
 
 		 242 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  31.91 
 
 		 233 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>