32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0617 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  49 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  45 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  43.98 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  53.76 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  36.43 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  30.15 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  28.86 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  28.06 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  29.17 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  29.94 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  30.53 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  36.03 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0571  protein of unknown function UPF0153  30.43 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  29.79 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  27.12 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  34.04 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  31.09 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  29.79 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  30.51 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  35.42 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  28.23 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  31.3 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  33.61 
 
 		 169 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  24.14 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  31.07 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5038  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  29.86 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5518  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.808773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  27.5 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  29.55 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  27.59 
 
 		 167 aa  43.9  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>