27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0519 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  93.31 
 
 		 239 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  44.12 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  47.16 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  40.91 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  32.5 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  31.91 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  24.59 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  36.17 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  34 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  33.98 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  33.64 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  34.04 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  32.73 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  29.79 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  31.78 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  30.77 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  25.95 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  29.63 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  34.55 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  36.73 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  25.32 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  27.45 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  33.02 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  25.88 
 
 		 229 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  29.2 
 
 		 253 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  24.05 
 
 		 229 aa  42  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>