34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0276 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  49.53 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  49.53 
 
 		 222 aa  214  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  46.79 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  45.41 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  44.6 
 
 		 239 aa  195  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  43.46 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  42.25 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  38.07 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  34.5 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  28.9 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  32.67 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  33.99 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  31.58 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  32.12 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  29.55 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  30.92 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  29.08 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  28 
 
 		 370 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  31.39 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  29.37 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  25.55 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  26.47 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  27.34 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  27.34 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  26.18 
 
 		 173 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  28.37 
 
 		 419 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  29.82 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  25.2 
 
 		 276 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  26.32 
 
 		 169 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  27.34 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1132  hypothetical protein  28.24 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  26.32 
 
 		 169 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  31.73 
 
 		 198 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>