36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1002 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  57.69 
 
 		 235 aa  274  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  26.96 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  31.91 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  29.53 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  30.29 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  36.5 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  32.03 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  33.85 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  26.7 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  27.78 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  26.61 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  33.65 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  27.82 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  38.54 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  27.61 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  29.03 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  27.19 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  26.32 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  27.34 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  27.27 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  26.15 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  26.71 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  26.02 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  27.36 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  30.56 
 
 		 200 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  21.37 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  30.7 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  31.73 
 
 		 226 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  28.57 
 
 		 223 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  29.63 
 
 		 225 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  26.42 
 
 		 229 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  37.11 
 
 		 233 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  30.63 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>