26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2855 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  91.56 
 
 		 225 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  38.6 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  43.89 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  40.12 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  33.83 
 
 		 235 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  41.42 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  37.64 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  39.01 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  37.74 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  32.24 
 
 		 272 aa  71.6  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  30.86 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  30.15 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  29.87 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  34.02 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  31.06 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  25.95 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  26 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  27.88 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2310  hypothetical protein  29.36 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  27.73 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  30.21 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  30.7 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  27.5 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  38.18 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>