20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4338 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  30.92 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5038  hypothetical protein  37.61 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5518  hypothetical protein  37.61 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.808773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  41.67 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  32.06 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2310  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776953 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  31.53 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  26.89 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  30.61 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  31.06 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  31.25 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  30.85 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0571  protein of unknown function UPF0153  28.97 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  26.15 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  28 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  28.12 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  28.26 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  29.91 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  33.71 
 
 		 251 aa  41.6  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>