28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0535 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  490  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  93.31 
 
 		 239 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  47.81 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  43.4 
 
 		 241 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  39.75 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  31.28 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  29.53 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  24.86 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  38.95 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  34 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  34.95 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  35.11 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  33.91 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  27.65 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  33.68 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  24.68 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  29.79 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  29.75 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  32.73 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  26 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  28.7 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  36.73 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  34.55 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  25.49 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  28.44 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  31.48 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  29.73 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  26.47 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>