25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1110 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  50.42 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  45.23 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  43.98 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  42.53 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  34.35 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  32.57 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  33.52 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  31.91 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  30.08 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  26.8 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  37.39 
 
 		 226 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  26.89 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  34.48 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  30.63 
 
 		 225 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  30 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  29.11 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  29.1 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  31.18 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2310  hypothetical protein  30.68 
 
 		 139 aa  45.8  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  29.55 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  29.2 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0571  protein of unknown function UPF0153  31.87 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5518  hypothetical protein  44.19 
 
 		 123 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.808773 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5038  hypothetical protein  44.19 
 
 		 123 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>