41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4265 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  47.98 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  48.57 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  45.51 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  45.98 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  32.9 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  28.48 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  29.7 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  29.94 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  30.26 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  27.22 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  31.78 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  29.41 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  28.07 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  31.4 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  27.34 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  28.49 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  27.91 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  28.89 
 
 		 239 aa  51.2  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4922  protein of unknown function UPF0153  33.73 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  30.6 
 
 		 346 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  30.66 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  29.58 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1132  hypothetical protein  33.64 
 
 		 181 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  26.24 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  30.84 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  26.15 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  25.76 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  27.56 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0571  protein of unknown function UPF0153  34.62 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  30.3 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  27.07 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0972  hypothetical protein  38.89 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  30.59 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  31.91 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  31.52 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  32.31 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2310  hypothetical protein  31.51 
 
 		 139 aa  41.6  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  31.82 
 
 		 253 aa  41.2  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  22.31 
 
 		 197 aa  41.2  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>