24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1399 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  90.53 
 
 		 169 aa  287  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  47.98 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  47.31 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  45.06 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  31.17 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  27.11 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  28.76 
 
 		 229 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  28.21 
 
 		 229 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  30.97 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  28.03 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  26.74 
 
 		 223 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  29.5 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  26.32 
 
 		 233 aa  48.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  26.32 
 
 		 226 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  26.37 
 
 		 239 aa  47.4  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  30.85 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  26.15 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  31.75 
 
 		 247 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  30.95 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  50 
 
 		 369 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2310  hypothetical protein  33.78 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  29.35 
 
 		 251 aa  41.2  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  25.27 
 
 		 217 aa  40.8  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>