29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1905 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  56.73 
 
 		 225 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  56.31 
 
 		 226 aa  246  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  53.11 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  53.4 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  52.91 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  49.77 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  52.43 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  31.69 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  29.55 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  29.93 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  32.65 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  30.43 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  31.39 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  27.01 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  27.74 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  27.94 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  31.88 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  27.22 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  22.58 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  33.65 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  27.5 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  26.61 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  25.74 
 
 		 173 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  28.03 
 
 		 169 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  27.59 
 
 		 370 aa  45.1  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  48.94 
 
 		 169 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  24.83 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  30.84 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>