32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1893 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 229 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  90.83 
 
 		 229 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  61.68 
 
 		 225 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  55.91 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  56.07 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  52.91 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  53.33 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  50.24 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  30.9 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  29.11 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  29.09 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  30.56 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  30.92 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  28.48 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  31.13 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  26.89 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  30.82 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  28.97 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  28.12 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  32.89 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  25.17 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  28.57 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  27.16 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  28.21 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  29.52 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  27.27 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  24.68 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  29.2 
 
 		 370 aa  45.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  27.12 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  27.36 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  25.36 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  24.05 
 
 		 239 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>