39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2118 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  57.69 
 
 		 234 aa  274  9e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  25.45 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  26.73 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  24.86 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  28.31 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  24.59 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  26.56 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  33.65 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  29.32 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  25.55 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  32.86 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  30.28 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  28.29 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  26.28 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  31.13 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  27.46 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  26.02 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  29.52 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1132  hypothetical protein  35.71 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  33.33 
 
 		 370 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  29.25 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  30.71 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  32.08 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  32.32 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  30.23 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2310  hypothetical protein  31.18 
 
 		 139 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776953 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  25.69 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  28 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  34.11 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  29.08 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  31.31 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  34.41 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  29.07 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  27.45 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  29.79 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>