21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0438 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  425  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0722  hypothetical protein  48.11 
 
 
200 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0972  hypothetical protein  41 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  38.38 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2610  hypothetical protein  42.62 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0379236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  35.98 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  27.34 
 
 
233 aa  55.1  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  25.58 
 
 
226 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  32.33 
 
 
346 aa  51.6  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  25.9 
 
 
232 aa  48.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  27.27 
 
 
239 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  26.88 
 
 
222 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  23.15 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  28.73 
 
 
207 aa  45.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  25.32 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  28.21 
 
 
222 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  29 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  24.15 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  25.36 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  32.31 
 
 
194 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  25.9 
 
 
229 aa  41.6  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>