31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2008 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  56.31 
 
 		 227 aa  246  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  53.33 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  55.29 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  52.86 
 
 		 229 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  50.68 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  50.96 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  46.6 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  34.48 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  30.5 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  34.78 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  30.82 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  31.47 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  25.12 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  31.69 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  29.14 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  29.08 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  30.26 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  25.29 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  26.62 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  25.58 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  31.13 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  23.94 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  26.32 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  34.38 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  27.19 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  26.32 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  24.48 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  29.25 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  26.98 
 
 		 419 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  23.48 
 
 		 370 aa  42  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>