27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1894 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  473  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  34.38 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  30.84 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  33.94 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  31.53 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  28.39 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  32.08 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  34.58 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  31.78 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  35.85 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  34.23 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  35.34 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  33.64 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  27.82 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  25.48 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  32.81 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  33.04 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  26.47 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  28.17 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  32.71 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  28.03 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  29.25 
 
 		 232 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  30.09 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  28.43 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>