28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2070 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  59.35 
 
 		 225 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  57.14 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  55.91 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  55.45 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  52.43 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  55.29 
 
 		 226 aa  231  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  49.76 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  31.58 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  31.88 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  32.19 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  32.19 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  30.32 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  28.17 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  33.61 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  27.78 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  28.67 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  26.95 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  28.07 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  25 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  31.17 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  28.14 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  30.28 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  31.61 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  25.95 
 
 		 173 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  27.61 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  31.93 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  31.82 
 
 		 198 aa  42  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>