32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1987 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  49.77 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  50 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  50.24 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  49.28 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  49.76 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  44.81 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  46.6 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  34.53 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  32.12 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  32.9 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  33.83 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  34.29 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  33.78 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  33.8 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  31.43 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  26.23 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  27.86 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  28.78 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  31.54 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  28.92 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  29.32 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  29.61 
 
 		 173 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  31.48 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  27.19 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  26.32 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  26.32 
 
 		 169 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  27.2 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1132  hypothetical protein  25.41 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  24.09 
 
 		 370 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  29 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  29.41 
 
 		 346 aa  42  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>