31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0114 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  71.04 
 
 		 222 aa  331  6e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  66.2 
 
 		 223 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  63.8 
 
 		 223 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  50.69 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  50.91 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  49.53 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  34.86 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  38.73 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  40.11 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  28.63 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  29.09 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  34.48 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  28.12 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  32.41 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  30.32 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  27.94 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  31.54 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  30.41 
 
 		 370 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  32.86 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  30.94 
 
 		 346 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  28.49 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  33.91 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  27.27 
 
 		 419 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  29.93 
 
 		 173 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  30.97 
 
 		 235 aa  45.1  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  28.21 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  26.71 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  28.39 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  26.62 
 
 		 175 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1132  hypothetical protein  29.1 
 
 		 181 aa  41.6  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>