15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0516 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  410  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  57.45 
 
 
202 aa  230  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2610  hypothetical protein  52.11 
 
 
204 aa  188  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0379236  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0722  hypothetical protein  51.58 
 
 
200 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0972  hypothetical protein  48.97 
 
 
245 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  35.98 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  27.91 
 
 
194 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  25 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  31.48 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  29.73 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  27.12 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  31.78 
 
 
232 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  31.82 
 
 
231 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  31.73 
 
 
233 aa  42  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  29.94 
 
 
222 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>