32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0083 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 
197 aa  407  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  40.29 
 
 
207 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  35.5 
 
 
222 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  35 
 
 
223 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  36.22 
 
 
207 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  38.07 
 
 
233 aa  134  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  34.86 
 
 
222 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  36.27 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  36 
 
 
223 aa  124  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  29.21 
 
 
239 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  25.93 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  26.23 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  27.08 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  25.29 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  22.58 
 
 
227 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  25.17 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  25.17 
 
 
229 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  25.17 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  25.14 
 
 
175 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  27.11 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  28.31 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  28.12 
 
 
235 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  23.36 
 
 
370 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  27.71 
 
 
169 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  23.15 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  27.45 
 
 
235 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  26.32 
 
 
245 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  28.19 
 
 
276 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  21.02 
 
 
231 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  22.31 
 
 
194 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>