18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0682 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  421  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  57.45 
 
 		 198 aa  230  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2610  hypothetical protein  53.43 
 
 		 204 aa  220  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0379236  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0722  hypothetical protein  52.13 
 
 		 200 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0972  hypothetical protein  47.6 
 
 		 245 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  38.38 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  27.27 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  29.35 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  36.36 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  30.52 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  26.45 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  28.38 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  30.56 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  28.39 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  30.59 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  29.25 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  28.18 
 
 		 237 aa  41.6  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  28.06 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>