33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1435 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  352  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  51.79 
 
 		 173 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  47.31 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  45.98 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  45.51 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  27.59 
 
 		 232 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  28.74 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  26.32 
 
 		 239 aa  62  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  29.08 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  31.11 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  25.93 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  28.92 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  27.5 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  26.47 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  25.14 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  28.14 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  27.16 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  30.47 
 
 		 227 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  28.12 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  23.94 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  27.34 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  28.26 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 		 247 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  30.56 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1132  hypothetical protein  33.02 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  26.47 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  28.12 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  26.62 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0571  protein of unknown function UPF0153  24.24 
 
 		 210 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  21.82 
 
 		 214 aa  41.2  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  26.47 
 
 		 115 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  27.33 
 
 		 198 aa  40.8  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>