30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1937 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  65.02 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  63.08 
 
 		 229 aa  275  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  61.68 
 
 		 229 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  59.35 
 
 		 231 aa  265  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  56.73 
 
 		 227 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  50.96 
 
 		 226 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  31.58 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  28.9 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  30.53 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  32.39 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  33.8 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  34.59 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  28.12 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  35.62 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  29.58 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  29.66 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  29.94 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  27.08 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  28.74 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  29.11 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  30.97 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  27.82 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  32.08 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  29.11 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  31.48 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  25.89 
 
 		 370 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  30.63 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  30.53 
 
 		 241 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>