23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3430 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  448  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  30.92 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  28.76 
 
 		 276 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  32.73 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  35.64 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  27.34 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  34.41 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  27.35 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  31.18 
 
 		 253 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  40.51 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  27.7 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0571  protein of unknown function UPF0153  28 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2310  hypothetical protein  32.88 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  28.79 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1729  protein of unknown function UPF0153  38.46 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  29.7 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  29.07 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  29.35 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  29.55 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  31.46 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2489  protein of unknown function UPF0153  25.58 
 
 		 166 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  31.52 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0246  hypothetical protein  26.49 
 
 		 169 aa  41.6  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>