18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1293 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  29.63 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  41.67 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  28.9 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  26.98 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  32.57 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  31.17 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  32.05 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  28.11 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  29.87 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  30.05 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  34.41 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  45.4  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  31.75 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  36 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  26.95 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  28.95 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  33.02 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>