27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1780 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  47.11 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  49 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  45.23 
 
 		 253 aa  198  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  48.55 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  30.23 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  31.18 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  29.81 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  30.86 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  37.17 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  25.57 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  28.9 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  30.39 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  26.78 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0571  protein of unknown function UPF0153  25.69 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  35.29 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  33.91 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  32.73 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  27.35 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2310  hypothetical protein  28.72 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  26.67 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  35 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  31.91 
 
 		 194 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5518  hypothetical protein  36.67 
 
 		 123 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.808773 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5038  hypothetical protein  36.67 
 
 		 123 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  28.3 
 
 		 245 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  30.11 
 
 		 169 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>