29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1586 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  41.62 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  38.6 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  35.5 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  38.32 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  37.33 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  37.36 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  36.22 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  34.78 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  28.82 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  26.97 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  25.57 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  34 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  34 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  30.5 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  30.93 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  27.38 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  27.83 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1293  protein of unknown function UPF0153  30.05 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.73928  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  31.25 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  26.36 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  34.11 
 
 		 235 aa  45.1  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  27.7 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0632  hypothetical protein  45.24 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  32.32 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  29.57 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0571  protein of unknown function UPF0153  27.4 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  29.63 
 
 		 234 aa  42  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>