34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1638 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  65.02 
 
 
225 aa  300  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  57.14 
 
 
231 aa  263  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  57.01 
 
 
229 aa  258  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  56.07 
 
 
229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  53.11 
 
 
227 aa  242  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  50.68 
 
 
226 aa  225  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  44.81 
 
 
224 aa  194  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  32.67 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  31.31 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  35.81 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  30.94 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  25.93 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  28.7 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  32.86 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  31.03 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  32.41 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  31.16 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  27.59 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  26.57 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  27.78 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  28.29 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  29.5 
 
 
169 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  25.9 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  24.46 
 
 
370 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  30.15 
 
 
169 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  28.38 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1132  hypothetical protein  31.25 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  27.46 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0516  hypothetical protein  31.78 
 
 
198 aa  42.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00475025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0722  hypothetical protein  31.48 
 
 
200 aa  42  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  25.95 
 
 
346 aa  41.6  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>