29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1089 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 173 aa  346  8e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  51.79 
 
 		 175 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  45.51 
 
 		 194 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1399  protein of unknown function UPF0153  45.06 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000886998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  44.44 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  29.23 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  26.57 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  30.57 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  28.12 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  29.11 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  25.25 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  30.43 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  28.31 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  29.61 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  28.17 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  26.18 
 
 		 233 aa  52  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2310  hypothetical protein  35.35 
 
 		 139 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  29.93 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  25.74 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  28.37 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  29.25 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  35.64 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  25.95 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1667  hypothetical protein  26.7 
 
 		 185 aa  47.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.131442 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0571  protein of unknown function UPF0153  38.55 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  24.48 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4338  hypothetical protein  28.26 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  27.42 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  27.59 
 
 		 214 aa  41.6  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>