29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1639 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  52.61 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  44.12 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  43.4 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  42.79 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  31.28 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  25.45 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  26.96 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  35.79 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  33.67 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  26.78 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  30.93 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  34.02 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  26.71 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  29.17 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  27.35 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  37.78 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  34.02 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  41.11 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  28.47 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  24.14 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  26.62 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  25.52 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  28.79 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  27.2 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  27.42 
 
 		 173 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  26.27 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0632  hypothetical protein  25.21 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  30.53 
 
 		 225 aa  42  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>