33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2197 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  418  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  50.86 
 
 
207 aa  181  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  40.8 
 
 
197 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  45.5 
 
 
222 aa  158  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  38.31 
 
 
227 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  42.25 
 
 
233 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  36.27 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  35.96 
 
 
223 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  38.73 
 
 
222 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  34.63 
 
 
239 aa  131  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  34.51 
 
 
225 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  30.94 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  27.86 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  30.34 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  28.28 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  28.97 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2070  hypothetical protein  29.37 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0957872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2008  hypothetical protein  28.87 
 
 
226 aa  62  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.060113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  32.82 
 
 
370 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  28.65 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  27.27 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  29.01 
 
 
346 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  31.31 
 
 
235 aa  51.6  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1089  protein of unknown function UPF0153  31.97 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0684639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  31.31 
 
 
235 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  26.92 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0438  hypothetical protein  24.64 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  27.82 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  27.18 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  46.43 
 
 
245 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  27.18 
 
 
419 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  26.67 
 
 
239 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  30 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.511938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>