21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2957 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  52.61 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  47.16 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  47.81 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  45.26 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  28.5 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  26.73 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  30.77 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  32.61 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  33.96 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  27.5 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  23.97 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  30.83 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  27.27 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1894  hypothetical protein  26.11 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0632  hypothetical protein  26.97 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  24.86 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  25.5 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  25.83 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  27.17 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  28.41 
 
 		 246 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>