13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1299 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  30.67 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  30.84 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  30.25 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2957  hypothetical protein  28.02 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  31.75 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2626  protein of unknown function UPF0153  29.44 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.135638  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  28.25 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  24.37 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  34.92 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  30.21 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  35.05 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>