71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20040 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  100 
 
 
170 aa  353  7.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  37.89 
 
 
173 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  33.12 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  35.26 
 
 
163 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  34.19 
 
 
164 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  35.1 
 
 
164 aa  104  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  31.48 
 
 
171 aa  98.2  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  32.8 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  39.02 
 
 
142 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 
258 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  32.32 
 
 
113 aa  57.8  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  36.05 
 
 
110 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  31.67 
 
 
222 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  55.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  36.36 
 
 
260 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  28.83 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  32.99 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  38.37 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  34.07 
 
 
242 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  39.76 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  39.76 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  33.94 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  33.63 
 
 
194 aa  50.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  27.78 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  29.52 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  29.21 
 
 
221 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  32.67 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  30.77 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  32.29 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  38.55 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  36.71 
 
 
257 aa  48.5  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  34.69 
 
 
250 aa  48.5  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1173  hypothetical protein  30.61 
 
 
211 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  26.42 
 
 
303 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  32.5 
 
 
258 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  30.17 
 
 
260 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  30.53 
 
 
265 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  32.5 
 
 
273 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  35.04 
 
 
140 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  31.76 
 
 
244 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1961  hypothetical protein  30.65 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  36.67 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  28.85 
 
 
242 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  25.76 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  40.96 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  32.65 
 
 
271 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  25.89 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  33.03 
 
 
141 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  25.69 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  28.75 
 
 
256 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  31.03 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0106  hypothetical protein  29.35 
 
 
209 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00415315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  37.18 
 
 
257 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0986  hypothetical protein  28.3 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0137  hypothetical protein  30.93 
 
 
209 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.314287  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  38.1 
 
 
124 aa  42.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3607  hypothetical protein  30.09 
 
 
133 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  30.61 
 
 
246 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  28.57 
 
 
245 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  31.71 
 
 
126 aa  41.6  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  27.5 
 
 
261 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  29.13 
 
 
273 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  23.58 
 
 
149 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0824  hypothetical protein  29.17 
 
 
142 aa  40.8  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  29.9 
 
 
112 aa  40.8  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  32.93 
 
 
137 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>