23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3044 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3044  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 231 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0010524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  91.42 
 
 		 233 aa  324  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2864  hypothetical protein  89.27 
 
 		 233 aa  304  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3551  hypothetical protein  55.17 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781941  hitchhiker  0.00439118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  40.57 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  41.92 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  40.91 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  36.61 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1586  hypothetical protein  37.2 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4145  hypothetical protein  36.99 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0219  hypothetical protein  30.22 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.215959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2090  protein of unknown function UPF0153  31.21 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  30.66 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0519  hypothetical protein  33.86 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0714534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1002  hypothetical protein  37.01 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.511938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1639  hypothetical protein  39.33 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0535  hypothetical protein  33.86 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  22.94 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  25.74 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  31.76 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1110  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3430  hypothetical protein  30.34 
 
 		 217 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  24.75 
 
 		 245 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>