48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0484 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  75.93 
 
 		 163 aa  240  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  57.89 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  56.86 
 
 		 173 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  53.8 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  45 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  34.19 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  26.38 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  36.11 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  27.89 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  26.79 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  28.87 
 
 		 276 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  31.82 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  35.05 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  27.84 
 
 		 273 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  32.26 
 
 		 245 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  29.46 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  32.04 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  29.46 
 
 		 124 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  33.71 
 
 		 124 aa  44.7  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1358  protein of unknown function UPF0153  32.32 
 
 		 225 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.01781e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  38.75 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  30.11 
 
 		 246 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  28.41 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  30.86 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  35.56 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  30.3 
 
 		 271 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  33.73 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  29.91 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  33.75 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  37.35 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  24.69 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  30.17 
 
 		 122 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  35.8 
 
 		 163 aa  42  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2950  protein of unknown function UPF0153  38.64 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0053762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2855  protein of unknown function UPF0153  38.18 
 
 		 225 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.671622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  30.86 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  38.64 
 
 		 231 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  30.86 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  26.83 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  21.43 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  28.05 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  24.14 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  23.81 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  25.77 
 
 		 110 aa  40.8  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  25 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>