40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0604 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  97.58 
 
 		 124 aa  244  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  95.97 
 
 		 124 aa  242  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  68.07 
 
 		 122 aa  168  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  54.78 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  48.78 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0638  hypothetical protein  54.17 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.821498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  52.54 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  45 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  33.98 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  35.96 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  36 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  32.14 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  31.46 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  32.38 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  32.48 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  33.02 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  32.95 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  31.03 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  29.46 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  31.46 
 
 		 273 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  32.26 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  30.1 
 
 		 281 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  28.85 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  32.32 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  34.74 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  32.26 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  32.65 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  30.34 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  29.46 
 
 		 163 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4540  protein of unknown function UPF0153  36.25 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  36.59 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  32.04 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  35 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  41.46 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>