35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0638 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0638  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  252  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.821498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  59.17 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  55 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  54.17 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  55.56 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  52.5 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  59.02 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  44.17 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  41.53 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  39.33 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  35.29 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  33.93 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  33.33 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  31.91 
 
 		 194 aa  53.5  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  34.04 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  31.25 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  31.96 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  31.82 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  31.03 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  31.91 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  34.48 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  26.09 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  32.32 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  35.23 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  30.85 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  30.85 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  30.77 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  32.95 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  32.95 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1505  hypothetical protein  41.03 
 
 		 216 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00212025  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  32.95 
 
 		 163 aa  40.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  26.97 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  29.73 
 
 		 246 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>