29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1540 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  306  5e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  36.43 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  31.82 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  33.08 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  28.21 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  32.5 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  25.58 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  28.7 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  34.04 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  30.25 
 
 		 152 aa  50.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  25.81 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  33.02 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  27.27 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  25.49 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  30.1 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  33.02 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  29.09 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  27.59 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  32.32 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  26.98 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  30.97 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  27.97 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0638  hypothetical protein  34.04 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.821498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  23.64 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  25.18 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  27.03 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  26.03 
 
 		 172 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  27.17 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>