34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0924 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  100 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  68.91 
 
 		 124 aa  171  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  68.07 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  68.07 
 
 		 124 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  55.65 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  51.24 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0638  hypothetical protein  55.56 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.821498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  49.14 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  52.07 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  37.25 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  33.98 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  30.7 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  31.82 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  33.04 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  30.77 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  34.41 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  29.09 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  31.91 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  29.79 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  34.02 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  25.93 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  30.43 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  34.48 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  28.41 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  30.17 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  32.98 
 
 		 142 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  37.8 
 
 		 163 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  27.96 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  32.58 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>