47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1546 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 186 aa  381  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  44.32 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  44.71 
 
 		 179 aa  137  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  43.37 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  44.67 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  37.73 
 
 		 237 aa  99.8  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  37.13 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  37.19 
 
 		 218 aa  91.3  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3209  protein of unknown function UPF0153  34.58 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.348826  normal  0.121177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0557  protein of unknown function UPF0153  31.91 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  30.94 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  32.72 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  28.48 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  33.02 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  32.79 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  33.01 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  34.44 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  34.02 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  33.64 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  29.77 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  33.94 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  22.54 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  28.38 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  29.13 
 
 		 142 aa  48.9  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  27.7 
 
 		 137 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  29.7 
 
 		 149 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  31.68 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  29.79 
 
 		 122 aa  45.8  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  32.98 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  33.68 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  27.52 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  27.17 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  22.14 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  28.43 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  31.58 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  29.47 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1193  hypothetical protein  28.28 
 
 		 161 aa  42  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0292793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  27.08 
 
 		 250 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  26.92 
 
 		 245 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  26.26 
 
 		 163 aa  41.2  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  27.01 
 
 		 271 aa  40.8  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  26.26 
 
 		 163 aa  41.2  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1853  protein of unknown function UPF0153  25.15 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  26.26 
 
 		 163 aa  41.2  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>