42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1120 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  287  3e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  80.29 
 
 		 137 aa  233  7e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  71.32 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  69.85 
 
 		 137 aa  215  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  146  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  48.67 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  43.81 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  35.63 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  32.18 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0824  hypothetical protein  29.13 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  37.39 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  30.77 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  35.05 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  29.46 
 
 		 444 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  35.04 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  28.7 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  34.12 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  31.25 
 
 		 250 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  31.07 
 
 		 126 aa  43.9  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  33.01 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  28.43 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  30.36 
 
 		 244 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  31.07 
 
 		 218 aa  42.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  27.68 
 
 		 244 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  36.36 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  29.27 
 
 		 222 aa  42  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  29.09 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  36.25 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  32.93 
 
 		 112 aa  40.8  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  30.91 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  26.57 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1262  protein of unknown function UPF0153  25.4 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  27.43 
 
 		 250 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  41.46 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1814  hypothetical protein  32.43 
 
 		 183 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.725605  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  30.48 
 
 		 271 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  34.65 
 
 		 142 aa  40  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  31.68 
 
 		 163 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>