25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0008 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  298  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  83.94 
 
 
137 aa  245  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  83.21 
 
 
137 aa  243  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  70.54 
 
 
172 aa  197  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  58.87 
 
 
155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  57.94 
 
 
137 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  57.14 
 
 
137 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  56.35 
 
 
137 aa  153  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  55.12 
 
 
164 aa  146  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  50.81 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  58.62 
 
 
119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  55.2 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  48.85 
 
 
165 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  54.03 
 
 
131 aa  144  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  48.85 
 
 
134 aa  143  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  48.85 
 
 
134 aa  143  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  50.81 
 
 
134 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  50.74 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  46.77 
 
 
151 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  59.43 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  33.93 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  31.75 
 
 
138 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  36.36 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  30.11 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  50 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>