16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0839 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  90.98 
 
 		 250 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  90.98 
 
 		 244 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  77.87 
 
 		 250 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4657  hypothetical protein  59.92 
 
 		 249 aa  308  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  56.61 
 
 		 250 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1137  hypothetical protein  55.14 
 
 		 251 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.290114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1262  protein of unknown function UPF0153  56.05 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1855  hypothetical protein  46.07 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5497  protein of unknown function UPF0153  40.52 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.30539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4406  hypothetical protein  37.15 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3943  hypothetical protein  34.78 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6825  hypothetical protein  37.45 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5135  protein of unknown function UPF0153  41.36 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4987  hypothetical protein  39.3 
 
 		 271 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0824  hypothetical protein  40.32 
 
 		 142 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>