17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1320 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1137  hypothetical protein  88.05 
 
 		 251 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.290114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4657  hypothetical protein  65.6 
 
 		 249 aa  338  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1262  protein of unknown function UPF0153  58.27 
 
 		 254 aa  305  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0800  hypothetical protein  58.26 
 
 		 250 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0824  hypothetical protein  57.85 
 
 		 244 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131616  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  57.02 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0839  hypothetical protein  56.61 
 
 		 244 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1855  hypothetical protein  40.98 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5497  protein of unknown function UPF0153  39 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.30539 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6825  hypothetical protein  42.19 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4406  hypothetical protein  35.29 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5135  protein of unknown function UPF0153  37.13 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3943  hypothetical protein  36.95 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4987  hypothetical protein  35.1 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.515451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  26.96 
 
 		 444 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  27.08 
 
 		 186 aa  42  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>