21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3505 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 
444 aa  904    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  25.87 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  41.07 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  40.98 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  35.62 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  29.46 
 
 
140 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  31.25 
 
 
384 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  31.25 
 
 
384 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  29.73 
 
 
141 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  40.74 
 
 
394 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  27.83 
 
 
229 aa  46.6  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  26.39 
 
 
222 aa  46.2  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  30.36 
 
 
137 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1320  hypothetical protein  26.96 
 
 
250 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  29.46 
 
 
137 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  31 
 
 
140 aa  44.3  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  35.09 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  40.74 
 
 
395 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1137  hypothetical protein  26.09 
 
 
251 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.290114 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0576  hypothetical protein  25.38 
 
 
270 aa  43.1  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>