27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0992 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  96.88 
 
 		 384 aa  722    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  762    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  32.58 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  30.77 
 
 		 414 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  26.79 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  28.76 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  30.94 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  23.54 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  23.45 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  42.2 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  22.11 
 
 		 394 aa  96.3  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  22.05 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  35.48 
 
 		 459 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  33.58 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  24.7 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  31.11 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  35.68 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  32 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  32 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  32.84 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  32.84 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  29.93 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  29.93 
 
 		 401 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  29.93 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  32.11 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  38.24 
 
 		 114 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  31.25 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>